此方法防治效果較好，但需嚴(yán)格掌握溫度，且操作較繁，大面積推廣應(yīng)用不太方便。
②恒溫浸種：將種子于44-46℃水中浸3小時(shí)，然后撈出，冷卻并晾干備用。恒溫浸種比較安全，并有良好的防治效果，可以將發(fā)病率降低到0.5%以下，便于大面積處理。
(2)生理殺菌處理
用生石灰和消石灰0.5千克，加清水50千克，可浸麥種30-50千克，水溫在20℃時(shí)浸3-4天，25℃時(shí)浸2-3天，35℃時(shí)只需1天。浸完后晾干播種。
此方法操作簡便，取材容易，效力也很高，明顯優(yōu)于溫湯浸種。在浸種過程中，麥種不易不過多，以種子厚度2尺為宜，以防底部種子發(fā)熱霉變。
石灰水浸種的菌絲作用，是一種生理殺菌。種子在無氧的情況下，產(chǎn)生乙酸或乙醛，殺死潛伏在種子內(nèi)部的菌絲體。在處理過程中，石灰只起防腐作用，與殺死種子內(nèi)潛伏的病菌并無關(guān)系。
(二)繁殖無病種子
在良種場或種子繁殖基地繁殖無病種子。種田距離大田至少在100米以外，所用種子，必須經(jīng)過嚴(yán)格的處理，保證全部無病。
做好無病種子的繁殖工作是防治此病的根本措施，可以免去種子處理的繁重工作。
(三)選育抗病品種
小麥散黑穗病菌生理小種變異速度較為緩慢，小麥對散黑穗病抗性是單基因顯性遺傳，抗原也豐富，有利于抗原品種的選育。
在選育抗病品種中，可以利用病菌不能進(jìn)入胚內(nèi)，或進(jìn)入胚內(nèi)但在分生組織發(fā)育上有差異，以及閉花授粉避病的特點(diǎn)進(jìn)行選育工作。
在選育小麥新品種的過程中，除針對當(dāng)?shù)亓餍行詮?qiáng)，毀滅性大的病害外，同時(shí)也應(yīng)將抗散黑穗病作為一項(xiàng)選育指標(biāo)，以供品種決選時(shí)參考。
