西洋芹常見的病害有斑枯病、斑點病、菌核病、鐮刀菌黃萎病、軟腐病、黑腐病和病毒病，防治方法主要是：選用抗病品種，如猶他系列品種抗鐮刀菌黃萎?。徊捎脦Ь俚姆N子，一般病菌在種子上可存活1年左右，用存放兩年的種子，就很少帶斑枯病和斑點病的致病菌，對于新種子可用48℃溫水浸種30分鐘，也基本可以殺滅病菌；實行2年以上輪作；加強田間溫濕度管理。在發(fā)病初期可用藥劑防治：
(1)斑點病、斑枯病、黑腐病、菌核病
用1：0.5；160-200波爾多液；50%代森錳鋅液800倍-l000倍液；75%百菌清600倍液-1000倍液；50%多菌靈可濕性粉劑500倍液-800倍液；70%甲基托布津800倍-1000倍液，交替使用，每7天-10天噴灑一次；
(2)鐮刀菌黃萎病
用50%多菌靈或50%苯來特可濕性粉劑500倍—1000倍；或50%治萎靈800倍-l000倍，每株200倍-500毫升灌根，每10天左右一次，連續(xù)3次-4次；(3)軟腐病要及時拔除病株消毀，或用濃石灰水消毒病穴。
(3)生理性病害
西洋芹常易發(fā)生缺鈣、缺硼，缺錳和缺鎂等缺素癥，栽培管理不當(dāng)或采收過遲易空心。
