花是芝麻的生殖器官，具有產(chǎn)生種子、繁殖后代的作用。每朵發(fā)育完全的芝麻花由苞葉、花柄、花萼、花冠、雄蕊和雌蕊6部分組成。
芝麻花柄較短，上部加粗部分為花托，著生花的其他各個(gè)部分。苞葉綠色，在花柄的基部，左右相對各有1個(gè)．長1厘米～2厘米，小者刺狀，大者呈披針形。
花萼綠色，一般5裂，具有5個(gè)刺狀萼片。花白色、粉紅色或紫色，因品種而異，筒形有明顯唇部，上部有5個(gè)花瓣，一大四小。
芝麻花冠在未開放前，邊緣折疊，拖合在一起，覆蓋著筒內(nèi)的雄蕊和雌蕊。這種結(jié)構(gòu)，可避免接收外來花粉，所以芝麻屬自花授粉作物。
在芝麻花冠基部與子房之間還有一圈黃色蜜腺，蜜腺和花冠的顏色都具有引誘蜜蜂傳粉的作用。因此，芝麻有一定異交率，其異交率一般在5%以下，屬常異花授粉。
在芝麻花冠內(nèi)壁上，著生有4枚、6枚或8枚雄蕊。雄蕊由花絲和花藥構(gòu)成。花絲細(xì)長，約十幾毫米，上端各著生1個(gè)花藥?；ㄋ幦榘咨?，有的品種花藥上還帶有紫筋。
花藥圍繞于雌蕊柱頭周圍，便于授粉?；ㄋ巸?nèi)有許多花粉粒，圓形，上有發(fā)芽孔。雌蕊位于整個(gè)花的中央，由花柱、柱頭和子房組成。子房位于雌蕊基部，有2個(gè)-4個(gè)心皮，并被分隔為4個(gè)、6個(gè)或8個(gè)假室，每個(gè)假室著生一排胚珠，將來結(jié)成一排種子。
子房向上為細(xì)長的花柱，花柱頂端裂開為柱頭，柱頭的裂敦為2裂、3裂或4裂，也與蒴果棱數(shù)和種子捧數(shù)相對應(yīng)。
